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期刊论文 7

年份

2023 2

2022 1

2021 2

2019 1

2014 1

关键词

REC114 1

ZNF438 1

不孕症 1

全外显子测序 1

化疗敏感性 1

叶斑病 1

叶片病斑进展 1

吉西他滨 1

外周血单核细胞 1

多囊卵巢综合征 1

指纹光谱特征 1

排卵反应 1

显症前诊断 1

深度机器学习 1

生化指标 1

群签名;格密码;验证者本地撤销;后向无关联性;小整数解难题 1

肝内胆管癌 1

防二重认证签名;变色龙哈希函数;数字签名;可证明安全;权威信任层次 1

高光谱成像 1

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Using hydrochemical signatures to characterize the long-period evolution of groundwater information in

《环境科学与工程前沿(英文)》 2021年 第15卷 第5期 doi: 10.1007/s11783-021-1393-7

摘要:

• The long-period groundwater evolution was identified by hydrochemical signatures.

关键词: Groundwater quality     Hydrochemical signatures     Spatial-temporal variations     Water-rock interactions     Anthropogenic interventions    

Detection of genomic signatures for pig hairlessness using high-density SNP data

Ying SU,Yi LONG,Xinjun LIAO,Huashui AI,Zhiyan ZHANG,Bin YANG,Shijun XIAO,Jianhong TANG,Wenshui XIN,Lusheng HUANG,Jun REN,Nengshui DING

《农业科学与工程前沿(英文)》 2014年 第1卷 第4期   页码 307-313 doi: 10.15302/J-FASE-2014039

摘要: Hair provides thermal regulation for mammals and protects the skin from wounds, bites and ultraviolet (UV) radiation, and is important in adaptation to volatile environments. Pigs in nature are divided into hairy and hairless, which provide a good model for deciphering the molecular mechanisms of hairlessness. We conducted a genomic scan for genetically differentiated regions between hairy and hairless pigs using 60K SNP data, with the aim to better understand the genetic basis for the hairless phenotype in pigs. A total of 38405 SNPs in 498 animals from 36 diverse breeds were used to detect genomic signatures for pig hairlessness by estimating between-population ( ) values. Seven diversifying signatures between Yucatan hairless pig and hairy pigs were identified on pig chromosomes (SSC) 1, 3, 7, 8, 10, 11 and 16, and the biological functions of two notable genes, and were revealed. When Mexican hairless pigs were contrasted with hairypigs, strong signatures were detected on SSC1 and SSC10, which harbor two functionally plausible genes, and . KEGG pathway analysis showed a subset of overrepresented genes involved in the T cell receptor signaling pathway, MAPK signaling pathway and the tight junction pathways. All of these pathways may be important in local adaptability of hairless pigs. The potential mechanisms underlying the hairless phenotype in pigs are reported for the first time. and are interesting candidate genes for the hairless phenotype in Yucatan hairless and Mexico hairless pigs, respectively. , , and as well as other genes involved in the MAPK and T cell receptor signaling pathways may be important in environmental adaption by improved tolerance to UV damage in hairless pigs. These findings improve our understanding of the genetic basis for inherited hairlessness in pigs.

关键词: hairlessness     pig     selective sweeping    

指纹光谱特征揭示叶斑病时空动态发展以实现显症前诊断 Article

朱逢乐, 苏珍珠, Alireza Sanaeifar, Anand Babu Perumal, Mostafa Gouda, 周瑞清, 李晓丽, 何勇

《工程(英文)》 2023年 第22卷 第3期   页码 171-184 doi: 10.1016/j.eng.2022.10.006

摘要:

植物病原菌不断危害农业生产和粮食安全。因此,病害发展早期的动态表征对病变监测和显症前诊断至关重要。高光谱成像(HSI)在跟踪病害初始侵染部位的动态进程以进行显症前诊断方面具有巨大潜力。然而,目前尚无相关文献提取出早期感染阶段活体叶片病变组织的指纹光谱特征(FSS),也没有探究HSI的检测机制。FSS是指能够表征特定植物病害的独特、有代表性的光谱特征。在本研究中,基于时序HSI数据分析,提取了接种麦根平脐蠕孢菌(Bipolaris sorokiniana)的大麦叶片的FSS,以表征叶斑病症状发展,实现显症前诊断。还研究了叶斑病早期发展阶段叶片的光谱和生化响应。本文所提取的全波段FSS能够捕捉病变发展过程中褪绿组织和坏死组织的独特特征,从而原位可视化植物-病原菌像素级的早期互作动态进程。进一步,实现了接种后24 h 叶斑病的显症前诊断,比传统的聚合酶链式反应(PCR)测定或生化测定提前了12 h。为了揭示HSI 显症前诊断的机制,还建立了叶片的平均光谱响应与其生化指标(叶绿素、类胡萝卜素、丙二醛、抗坏血酸和还原型谷胱甘肽)之间的定量关系,回归模型在预测集的决定系数(Rp2)均高于0.84。总体结果表明,HSI反映了活体植物特性的变化,所提取的FSS可成功跟踪叶斑病发生发展的时空动态进程,实现显症前诊断。在其他植物病害上的试验表明,该方法在植物病害早期控制方面具有较大的推广潜力。

关键词: 高光谱成像     指纹光谱特征     叶斑病     叶片病斑进展     显症前诊断     生化指标    

再议防二重认证签名:新定义和基于变色龙哈希的构造 None

Fei LI, Wei GAO, Gui-lin WANG, Ke-fei CHEN, Chun-ming TANG

《信息与电子工程前沿(英文)》 2019年 第20卷 第2期   页码 176-186 doi: 10.1631/FITEE.1700005

摘要: 防二重认证签名(DAPS)是在ESORICS 2014会议上提出的一种新型电子签名。防二重认证性质指同一主题上两个不同消息的签名可以用来摧毁整个签名体系。其提出者已指出防二重认证签名的几个潜在应用场景,比如,在数字证书领域,可以提供针对证书颁发机构(CA)的自我约束体制,使其不敢违规提供假冒证书。本文主要考虑防二重认证签名的基础性质。提出一种适度弱化条件的新定义,同时为刻画防二重认证性质而保持足够性质强度。提出带密钥泄露的可逆变色龙哈希函数的新密码原型。提出防二重认证签名方案的通用构造,同时基于带密钥泄露的可逆变色龙哈希函数性质给出安全性证明。在此通用型防二重认证签名方案框架下,分别基于整数分解、不对称密码算法(RSA)和狄菲-赫尔曼计算(CDH)假设构造了3个具体的防二重认证签名方案。这些方案比现有的防二重认证签名方案效率更高。相比现有方案,分别基于RSA和CDH的两个新方案不再依赖可信系统建立模型。

关键词: 防二重认证签名;变色龙哈希函数;数字签名;可证明安全;权威信任层次    

格上后向无关联性安全的验证者本地撤销群签名 Research Articles

张彦华1,刘西蒙2,胡予濮3,甘勇4,贾惠文5

《信息与电子工程前沿(英文)》 2022年 第23卷 第6期   页码 876-892 doi: 10.1631/FITEE.2000507

摘要:

群成员可撤销的群签名中,验证者本地撤销机制似乎是一种更为灵活的选择,因为在签名验证过程中,仅需验证者获取最新的撤销信息,而不涉及签名者。与经典的数论型构造相对应,Langlois等人给出了后量子安全的首个格上验证者本地撤销群签名。然而,截至目前,所有格上验证者本地撤销群签名方案暂不满足后向无关联性,该特性可保障群成员被撤销前其对消息签名的匿名性和无关联性。本文给出了首个格上后向无关联性安全的验证者本地撤销群签名方案,从而解决了这一公开问题。新方案为群公钥和群成员签名密钥节省了O(log N)的比特大小,并且没有任何公钥加密。特别地,新方案在随机谕言机模型下是可证明安全的,其困难性可归约至两个经典格上难题假设,即小整数解难题和差错学习难题。

关键词: 群签名;格密码;验证者本地撤销;后向无关联性;小整数解难题    

外周血免疫特征预测肝内胆管癌患者化疗敏感性 Article

吴彤, 杨应成, 郑博, 施学兵, 李炜, 马文聪, 王珊, 李祉萱, 朱妍静, 吴建民, 汪凯婷, 赵燕, 伍睿, 隋成军, 莘似韵, 吴璇, 陈磊, 袁振刚, 王红阳

《工程(英文)》 2021年 第7卷 第10期   页码 1381-1393 doi: 10.1016/j.eng.2021.01.014

摘要:

肝内胆管癌(ICC)是第二常见肝癌。化疗仍然是晚期ICC患者的主要治疗方法,但是化疗敏感性因人而异。在本研究中,我们使用飞行时间质谱仪(CyTOF)在单细胞水平上建立ICC患者在化疗前、化疗中和化疗后指定时间点外周血单核细胞(PBMC)的免疫谱;应用多重免疫荧光染色展现某些特定免疫亚群的空间分布;使用组织微阵列(TMA)评估患者预后。本研究共招募了20名接受吉西他滨(GEM)治疗的ICC患者,其中8例对化疗反应良好(R),12例无反应(NR)。我们观察到化疗后患者PBMC组成发生了巨大变化,比如CD4/CD8 双阳性T细胞(DPT)水平增加。治疗前CD4+CD45RO+CXCR3+T细胞水平较高的患者对化疗反应良好。我们的研究确定了T细胞亚群的百分比与患者化疗反应性之间存在正相关关系,这表明通过评估PBMC中细胞亚群的比例来预测ICC患者化疗反应性是可行的。

关键词: 肝内胆管癌     吉西他滨     化疗敏感性     外周血单核细胞    

多囊卵巢综合征无排卵的胰岛素信号和雄激素合成的新遗传风险和代谢特征 Article

吴效科, 黄志超, 曹义娟, 李建, 李志强, 马红丽, 高敬书, 常惠, 张多加, 丛晶, 王宇, 吴奇, Xiaoxiao Han, Pui Wah Jacqueline Chung, Yiran Li, Xu Zheng, Lingxi Chen, Lin Zeng, Astrid Borchert, Hartmut Kuhn, Zi-Jiang Chen, Ernest Hung Yu Ng, Elisabet Stener-Victorin, 张和平, Richard S. Legro, Ben Willem J. Mol, 师咏勇

《工程(英文)》 2023年 第23卷 第4期   页码 103-111 doi: 10.1016/j.eng.2022.08.013

摘要:

促排卵是多囊卵巢综合征(PCOS)不孕症的一线治疗方案。卵巢对促排卵治疗的排卵应答差被认为与胰岛素抵抗和高雄激素血症相关。在一个包含1000名PCOS不孕妇女(PCOSAct)的前瞻性队列中,我们开展了一项全外显子联合靶向单核苷酸多态性(SNP)测序以及代谢组学研究。在全基因组水平找出与无排卵显著相关的常见变异和罕见突变,并通过机器学习算法构建排卵预测模型。研究发现,ZNF438基因中标记为rs2994652 (p=2.47×10–8)的常见变异和REC114基因中的一个罕见功能突变(rs182542888,p=5.79×10–6)与促排卵治疗失败显著相关。携带rs2994652 A等位基因和REC114 p.Val101Leu (rs182542888)的PCOS不孕妇女进行促排卵治疗的总排卵率更低(分别为:比值比 (OR)=1.96,95% 置信区间(CI)[1.55~2.49];OR=11.52,95% CI [3.08~43.05]),出现排卵的间隔时间更长(平均56.7天vs.49.0天,p<0.001;78.1天vs.68.6天,p=0.014)。对于rs2994652突变者,L-苯丙氨酸水平升高并与胰岛素抵抗稳态模型(HOMA-IR)指数(r=0.22, p=0.05)和空腹血糖(r=0.33, p=0.003)呈正相关;对于rs182542888突变者,花生四烯酸代谢产物水平下降并与升高的抗苗勒管激素(r=-0.51, p=0.01)和总睾酮(r=-0.71, p=0.02)呈负相关。整合基因变异位点、代谢产物及临床特征的联合预测模型可提高对排卵的预测能力[曲线下面积(AUC)=76.7%]。ZNF438基因的一个常见变异和REC114基因的一个罕见功能突变,以及与二者相关的苯丙氨酸和花生四烯酸代谢物改变,与PCOS女性不孕症的促排卵治疗失败相关。

关键词: 多囊卵巢综合征     不孕症     排卵反应     ZNF438     REC114     全外显子测序     深度机器学习    

标题 作者 时间 类型 操作

Using hydrochemical signatures to characterize the long-period evolution of groundwater information in

期刊论文

Detection of genomic signatures for pig hairlessness using high-density SNP data

Ying SU,Yi LONG,Xinjun LIAO,Huashui AI,Zhiyan ZHANG,Bin YANG,Shijun XIAO,Jianhong TANG,Wenshui XIN,Lusheng HUANG,Jun REN,Nengshui DING

期刊论文

指纹光谱特征揭示叶斑病时空动态发展以实现显症前诊断

朱逢乐, 苏珍珠, Alireza Sanaeifar, Anand Babu Perumal, Mostafa Gouda, 周瑞清, 李晓丽, 何勇

期刊论文

再议防二重认证签名:新定义和基于变色龙哈希的构造

Fei LI, Wei GAO, Gui-lin WANG, Ke-fei CHEN, Chun-ming TANG

期刊论文

格上后向无关联性安全的验证者本地撤销群签名

张彦华1,刘西蒙2,胡予濮3,甘勇4,贾惠文5

期刊论文

外周血免疫特征预测肝内胆管癌患者化疗敏感性

吴彤, 杨应成, 郑博, 施学兵, 李炜, 马文聪, 王珊, 李祉萱, 朱妍静, 吴建民, 汪凯婷, 赵燕, 伍睿, 隋成军, 莘似韵, 吴璇, 陈磊, 袁振刚, 王红阳

期刊论文

多囊卵巢综合征无排卵的胰岛素信号和雄激素合成的新遗传风险和代谢特征

吴效科, 黄志超, 曹义娟, 李建, 李志强, 马红丽, 高敬书, 常惠, 张多加, 丛晶, 王宇, 吴奇, Xiaoxiao Han, Pui Wah Jacqueline Chung, Yiran Li, Xu Zheng, Lingxi Chen, Lin Zeng, Astrid Borchert, Hartmut Kuhn, Zi-Jiang Chen, Ernest Hung Yu Ng, Elisabet Stener-Victorin, 张和平, Richard S. Legro, Ben Willem J. Mol, 师咏勇

期刊论文